Cette commission a pour objectif d'offrir aux membres un forum où ils puissent exprimer leur commune foi chrétienne, rechercher à mieux se comprendre mutuellement et identifier et examiner les questions théologiques faisant l'objet de leurs préoccupations communes.
L'examen des positions éthiques de ses Églises membres révéla à la Commission Foi et Témoignage une remarquable convergence au sujet de l'euthanasie et du suicide assisté On publia, à Noël 1996, une déclaration à ce sujet. On publia également une brochure intitulée " Directives proposées pour des cérémonies religieuses incluant plus d'une tradition religieuse. "
La Commission Foi et Témoignage comprend aussi un groupe qui rédige et distribue les ressources en vue de la célébration mondiale de la Semaine de prière pour l'unité chrétienne.
Il s'est développé chez les membres un respect mutuel grandissant des pratiques de prière et de liturgie. Aux réunions du Conseil il leur arrive, par exemple, de chanter les hymnes mennonites - les Mennonites ont le statut d'observateurs au Conseil - de prendre part à une réflexion biblique animée par un évêque catholique et de prier selon l'une des traditions orthodoxes. Peu après l'invasion de l'Irak et 2003, à laquelle le Conseil s'est opposé, la Commission Foi et Témoignage et les dirigeants de toutes les Églises membres ont participé, à Toronto, à une grande cérémonie de prière, de musique et de lumières en défi aux ténèbres.
Bien que les Églises membres maintiennent diverses positions théologiques et divergent d'opinions sur des questions telles que l'avortement, le mariage entre personnes de même sexe et le rôle de la femme dans l'Église, elles ont souvent présenté, au fil des ans, un front commun sur bien des questions sociales.
La Commission Justice et Paix est le bras du Conseil qui spécialise dans la réflexion, l'étude et l'action théologiques relatives à ces questions. Sur certaines de ces dernières, comme la biotechnologie, les deux commissions travaillent en collaboration.
La pauvreté infantile fut une des grandes préoccupations des années 1990. C'est dans cette période que la Commission parraina au Canada, aux côtés de coalitions œcuméniques, des Forums Paix et Justice, dont un axé sur la pauvreté infantile.
Un mois après les attentats terroristes de septembre 2001 contre New York et Washington, les dirigeants de 13 membres du Conseil canadien des Églises demandèrent aux États-Unis, à la Grande-Bretagne et au Canada de démilitariser la bataille contre le terrorisme. Ils soutenaient que la campagne militaire ne réussirait qu'à dévaster davantage un Afghanistan déjà mutilé, sans pour autant réussir à capturer les accusés.
Le gouvernement prête-t-il l'oreille à ces initiatives œcuméniques en faveur de la paix et de la justice sociale?
De septembre 2002 à mars 2003, les dirigeants des Églises membres adressèrent au premier ministre Jean Chrétien, par l'entremise du Conseil, trois lettres lui demandant de trouver des moyens de régler la question de l'Irak sans recours à l'invasion militaire.
Le Conseil organisa, en janvier 2003, en collaboration avec ses partenaires Project Ploughshares et KAIROS : Initiatives œcuméniques canadiennes pour la Justice, une pétition demandant de rechercher des solutions de rechange à la guerre en Irak. La pétition recueillit la signature de plus de 44 000 Canadiens et Canadiennes.
Le gouvernement canadien décida de ne pas envoyer de troupes canadiennes en Irak, tout en maintenant des troupes en Afghanistan contre le terrorisme et en aide à la reconstruction du pays.
En 2004, le Conseil canadien des Églises co-anima une consultation sur la mondialisation appelée " Des accords commerciaux équitables? ", dans le dessin de relever les résultats négatifs de l'Accord de libre-échange d'Amérique du Nord et de lancer un plan d'action promouvant le " commerce équitable " dans l'hémisphère.